Search publications of the members of the Royal Belgian institute of natural Sciences
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Utilisation du micro CTscan pour la préparation virtuelle et mécanique d’un crâne de crocodilien du Paléocène de Chine
- Depuis plusieurs années, la microtomographie à rayons X calculée par ordinateur (CTscan) a pris une place importante dans les laboratoires de paléontologie des vertébrés, jusqu’à remplacer dans certains cas les méthodes traditionnelles de préparation mécanique, pour l’étude de spécimens fossiles. Ces CTscans permettent aux chercheurs d’étudier des caractères autrement impossibles à observer, tout en préservant au maximum le spécimen de toute technique intrusive. Cependant il est souvent nécessaire d’effectuer tout de même une préparation physique du fossile, combinant ainsi les techniques virtuelles et mécaniques afin d’améliorer l’étude d’un spécimen ou encore pour permettre l’exposition de ce dernier. Le crâne de crocodilien de cette étude provient du site paléocène moyen de Qianshan dans la province d’Anhui en Chine. Il a été découvert lors des expéditions sinobelges de l’Institut royal des Sciences naturelles de Belgique (IRSNB) qui ont eu lieues de 2008 à 2011. Seule la face ventrale du crâne a été dégagée, présentant un os très fin, fragile et fragmentaire, ainsi que quelques dents encore en position. La finesse de l’os, additionnée à des sutures très marquées suggère un individu juvénile. La face dorsale du crâne étant complètement recouverte par la matrice gréseuse, le spécimen a été scanné à l’aide du micro CTscanner EasyTOM 150 de l’IRSNB, ceci afin de le manipuler virtuellement dans son entièreté, pouvoir l’étudier et aussi le visualiser avant sa préparation physique. En effet, la fragilité des os et le manque de visibilité de la face dorsale rendent la préparation très risquée et demandent un temps considérable. La segmentation virtuelle a été réalisée sur le logiciel Materialise Mimics 19,0 (x64) (Materialise NV, Leuven, Belgique) pour séparer l’os de la matrice puis pour modéliser le crâne en trois dimensions. Le contraste entre les os et la matrice est par endroit très faible (dû à un os très fin et une matrice siliceuse) et il a fallu environ une quinzaine d’heures de travail pour obtenir une reconstitutioncomplète du crâne. Au terme de cette segmentation, deux os périphériques au crâne se sont relevés appartenir à une mandibule (angulaire et surangulaire) montrant une large fenêtre mandibulaire. D’autres fragments d'os isolés du crâne ont aussi été identifiés virtuellement dans la matrice. La segmentation du crâne en luimême a révéléun crâne relativement bien conservé, le côté droit étant fragmentaire. Les coupes tomographiques ont également mis en évidence de nombreuses fissures dans la roche, pour beaucoup traversant de part en part le crâne. Toutes ces informations récupérées en amont de la préparation ont permis de faire une analyse complète du travail physique à effectuer et de planifier la meilleure approche possible (localiser les caractères diagnostiques importants à dégager, les fractures dans l'os ou les fragments isolés, stabiliser les fissures ou encore tenir compte de l'épaisseur de l'os). Le tout facilite grandement la préparation et diminue les risques d’endommager le spécimen. Cette étude de cas montre déjà l’intérêt de telles technologies pour les chercheurs mais souligne à quel point cette nouvelle technique de préparation est utile dans la boite à outils déjà bien grande des préparateurs.
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A note on the genus Rugosophysis Komiya & Drumont, 2008 (Contribution to the knowledge of Indonesian Prioninae - 1) (Coleoptera, Cerambycidae, Prioninae)
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Economic analysis of CO2-EOR under uncertainty
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The colour pattern of Idunella picta (Norman, 1889) is interpreted as mimetism with dark plant debris (Crustacea, Amphipoda, Liljeborgiidae)
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A new giant Lipkius-like shrimp from the Crozet Islands (Crustacea, Decapoda, Caridea)
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Stable isotopes reveal effects of environmental changes on ecological niches of Iphimediidae amphipods
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Validating fish and seafood labelling using DNA barcoding
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Invasive Alien Species in Belgium (IAS): examining the utility of Genbank and BOLD for species identifications
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Monitoring of Exotic MOsquitoes in Belgium (MEMO): molecular validations of morphological species identifications
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Complex effect of projected sea temperature and wind change on flatfish dispersal
- Climate change not only alters ocean physics and chemistry but also affects the biota. Larval dispersal patterns from spawning to nursery grounds and larval survival are driven by hydrodynamic processes and shaped by (a)biotic environmental factors. Therefore, it is important to understand the impacts of increased temperature rise and changes in wind speed and direction on larval drift and survival. We apply a particle-tracking model coupled to a 3D-hydrodynamic model of the English Channel and the North Sea to study the dispersal dynamics of the exploited flatfish (common) sole (Solea solea). We first assess model robustness and interannual variability of larval transport over the period 1995-2011. Then, using a subset of representative years (2003-2011), we investigate the impact of climate change on larval dispersal, connectivity patterns and recruitment at the nursery grounds. The impacts of five scenarios inspired by the 2040 projections of the Intergovernmental Panel on Climate Change are discussed and compared with interannual variability. The results suggest that 33% of the year-to-year recruitment variability is explained at a regional scale and that a 9-year period is sufficient to capture interannual variability in dispersal dynamics. In the scenario involving a temperature increase, early spawning and a wind change, the model predicts that (i) dispersal distance (+70%) and pelagic larval duration (+22%) will increase in response to the reduced temperature (–9%) experienced by early hatched larvae, (ii) larval recruitment at the nursery grounds will increase in some areas (36%) and decrease in others (-58%), and (iii) connectivity will show contrasting changes between areas. At the regional scale, our model predicts considerable changes in larval recruitment (+9%) and connectivity (retention -4% and seeding +37%) due to global change. All of these factors affect the distribution and productivity of sole and therefore the functioning of the demersal ecosystem and fisheries management.
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Current status of deepwater oil spill modelling in the Faroe-Shetland Channel, Northeast Atlantic, and future challenges
- Abstract As oil reserves in established basins become depleted, exploration and production moves towards relatively unexploited areas, such as deep waters off the continental shelf. The Faroe-Shetland Channel (FSC, NE Atlantic) and adjacent areas have been subject to increased focus by the oil industry. In addition to extreme depths, metocean conditions in this region characterise an environment with high waves and strong winds, strong currents, complex circulation patterns, sharp density gradients, and large small- and mesoscale variability. These conditions pose operational challenges to oil spill response and question the suitability of current oil spill modelling frameworks (oil spill models and their forcing data) to adequately simulate the behaviour of a potential oil spill in the area. This article reviews the state of knowledge relevant to deepwater oil spill modelling for the FSC area and identifies knowledge gaps and research priorities. Our analysis should be relevant to other areas of complex oceanography.
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Découverte de Tropideres albirostris (Schaller, 1783) en Région de Bruxelles-Capitale (Coleoptera: Anthribidae)
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A new Antarctic species of Orchomenella G.O. Sars, 1890 (Amphipoda: Lysianassoidea: Tryphosidae): is phasecontrast micro-tomography a mature technique for digital holotypes?
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Phylogenomics and biogeography of sawflies and woodwasps (Hymenoptera, Symphyta)
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BopCo: an identification service for species of policy concern, and its role in the Belgian speciesid.be consortium
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Fish movement
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AUTOMATIC MONITORING OF BIODIVERSITY IN THE NORTH SEA USING eDNA (Zero-Impact)
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Compartive genetic analysis of invasive mosquito species in Belgium supports diverse introduction pathways
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BOPCO: An identification service for species of policy concern, including invasive alien species
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Application of environmental DNA and quantitative PCR to detect the presence of four invasive crayfish species in Brussels waterbodies (Belgium)
